1. У Николаса было всего несколько дней, чтобы разобраться со считалкой:

Прыг-скок, прыг-скок
С каблука на носок,
Не на запад, на восток,
С оселка на брусок.
Прыг-скок, прыг-скок,
И башкой об потолок.

И он не смог. У него не было времени на другое, у него не было источников информации, кроме обрывка письма и двух теткиных компаньонов - ему просто негде было что-то узнать.
2. "кто такой Лепин". И я не знаю... В романе такого нет.
3. "удивительно плоский, неинтересный и несимпатичный герой". Второе и третье определение индивидуально, первое - неверно. Мне Николас импонирует, вот жена его нет.
4. "как у Акунина получаются такие книги" - да как и у других, которые много их натворили. Невозможно писать постоянно и много на одном хорошем уровне.

Обоснованных. Обоснованных претензий к персонажам этой книги можно найти достаточно.
Попугай.
У птицы человеческий разум и интеллект. Как она утверждает, - читаю на восьми языках, понимаю шесть. Но пишу, как курица лапой.
Поверим на слово.
Нежели за 50 лет не придумать какие-то способы коммуницировать с хозяевами? Система подсказок шулеру ведь действовала, выработали ее они вместе.
С Николасом же птица ничего не успела достичь. Только кудахтала.
Грей.
Фанатик моря, на шее медальон с изображением его судна "Русалка". Кто бы сомневался,
что в финале он на деньги брата построит себе новый корабль. И вдруг на тебе. Совершенно дурной исход морских приключений для него и Летиции. Прозябать до конца дней на необитаемом острове, где кроме секса никаких других занятий не придумаешь...
Такое ли прекрасное будущее для этой пары виделось Александру Грину? 
Разве что в жутких алкогольных снах.